La Real Academia de Ciencias Veterinarias de Andalucía Oriental lleva rigiéndose, desde el año 1993, por los Estatutos modificados que fueron objeto de aprobación mediante Orden de la Consejería de Educación y Ciencia de la Junta de Andalucía, de fecha 5 de octubre.

Por otra parte, en su contenido se habla del Pleno de la Academia (artículo 10 de los Estatutos) que designará, de entre sus miembros Numerarios a la Junta Rectora, formada a su vez por un Presidente, tres Vicepresidentes, un Secretario General, un Contador, un Tesorero y un Bibliotecario, cargos renovables cada cuatro años. Y finalmente se contempla también la existencia de una Junta de Gobierno (art. 12º del Reglamento de Régimen Interior) a la que se atribuyen funciones de índole económica.